Risale al sec. XI. La nomina dell'operaio veniva fatta dai supremi magistrati del comune.
Caduta Pisa sotto il dominio fiorentino, anche la nomina divenne di competenza fiorentina, sia pure con qualche ingerenza da parte del comune. Annessa la Toscana al l'impero francese l'operaio fu sostituito da un consiglio di nove membri, di cui cinque a scelta dell'arcivescovo e quattro a scelta del prefetto. Restaurato il governo toscano si tornò, come negli ultimi anni del sec. XVIII, alla nomina granducale L'amministrazione dell'opera riguardava non solo la chiesa primaziale ma anche il battistero di S. Giovanni