Il dipartimento del Trasimeno, con capoluogo Perugia, era diviso in tredici cantoni: Castiglione del Lago,Città della Pieve, Città di Castello, Deruta, Ficulle [ In provincia di Terni ] Gualdo (Gualdo Tadino), Gubbio. Marsciano, Monte Santa Maria (Monte Santa Maria Tiberina), Nocera (Nocera Umbra), Panicale, Passignano (Passignano sul Trasimeno), ai quali vanno aggiunti il cantone urbano e il cantone rurale di Perugia; ogni cantone aveva una municipalità e un prefetto consolare.