Istituito per interessamento del provveditore di Padova Andrea Memmo e del vescovo Nicolò Antonio Giustinian, venne inaugurato ufficialmente il 29 marzo 1798, subentrando al pio ospitale di S. Francesco, ed ebbe sede nel soppresso convento dei gesuiti. Istituita nel 1807 la congregazione di carità, l'ospedale passò sotto la sua amministrazione [ Sciolta la congregazione nel 1818, l'amministrazione dell'ospedale passava alla prepositura fino al 1872]