Nel secondo congresso cispadano fu decisa la trasformazione della confederazione cispadana in repubblica una ed indivisibile. In base alla costituzione cispadana il potere legislativo venne affidato a due camere: il consiglio dei sessanta e il consiglio dei trenta; il potere esecutivo a un direttorio formato da tre membri. Il 26 aprile il corpo legislativo si riunì a Bologna ed il 28 elesse il direttorio esecutivo  [Raccolta dei bandi, notificazioni, editti, etc., pubblicati in bologna dopo l'ingresso delle truppe francesi, Bologna, Sassi, t. XVI, p. 107.]  da tale data fino alla successiva annessione alla repubblica cisalpina, il governo stabilito dalla costituzione svolse regolarmente la propria attività