Fu istituito di fatto nel 1737 da Francesco Stefano di Lorena alla morte di Gian Gastone dei Medici. In un primo tempo si componeva di cinque membri ed era presieduto dal principe Marco di Craon. Aveva competenza per tutti gli affari e governava seguendo le istruzioni del sovrano il quale, a sua volta, aveva istituito presso la corte di Vienna un consiglio di Toscana. Il 25 aprile 1739  [Bandi Toscana, cod. III, s. n]  furono creati i consigli di reggenza, di finanze e di guerra.
A quello di reggenza fu affidata la sorveglianza sull'amministrazione della giustizia, sulla conservazione dell'ordine pubblico, sul progresso dell'istruzione universitaria, delle arti e del commercio, e la difesa delle prerogative della corona. Fu sottoposta alle sue dipendenze la segreteria di Stato, organo attraverso il quale esso esercitava le sue incombenze: di qui la denominazione di consiglio di Stato e di reggenza. Il 30 settembre 1746 fu abolito il consiglio di guerra i cui compiti passarono al consiglio di reggenza, e nel novembre del 10 stesso anno fu abolito il consiglio di finanze. Con l'avvento di Pietro Leopoldo, il 21 settembre 1765, il consiglio di reggenza venne sostituito col consiglio di Stato e furono ristrutturate le segreterie; in questa occasione fu organizzata anche la segreteria di Stato