Provvedeva ad amministrare i beni residui dopo la cessazione dell'attività dell'amministrazione dei beni ecclesiastici; la sua attività si svolse soprattutto con la cessione di tali beni in enfiteusi a terza generazione e con altri simili contratti, finché verso il 1850 fu decisa la vendita all'asta di tutti i beni ancora rimasti ed il commissariato cessò da ogni attività. Aveva la stessa competenza territoriale della precedente amministrazione generale