Gli archivi veri e propri delle corporazioni religiose soppresse costituiscono un complesso, fornito di inventario, chiamato tradizionalmente " fondo di religione ".
Da tale complesso furono estratte, nel 1808 e nel 1840, 16.378 pergamene trasferite a Milano, dove tuttora si trovano presso il Diplomatico dell'AS Milano . I registri che qui restano rappresentano la parte amministrativa e contabile degli archivi delle corporazioni stesse. Il fondo contiene inoltre 122 buste relative ad atti processuali ad esse pertinenti.
Tutti i fondi delle diocesi sono forniti di inventario