Comprende le pergamene estratte - nel corso della formazione dell'Archivio diplomatico - dagli archivi degli enti religiosi soppressi nella Lombardia durante la repubblica cisalpina, la repubblica italiana e, infine il regno di Italia. Sono ordinate per fondi di provenienza, quali erano all'atto della soppressione degli enti, posti in ordine alfabetico; pertanto vi è, in linea di massima, corrispondenza con l'ordine degli archivi degli enti soppressi compresi nel Fondo di religione .
La suddivisione per località rispecchia le province del regno lombardo veneto al tempo in cui l'Archivio diplomatico era diretto da Luigi Settala