Il governo si divideva in senato politico, per l'amministrazione e la polizia, e senato camerale - le cui carte sono confluite nel fondo Atti di governo - per le materie economiche, cui subentrò nel 1830 il magistrato camerale, le cui carte furono distrutte nel 1943.
L'archivio della presidenza era distinto in affari generali e affari riservati. Gli affari generali furono distrutti nel 1943, mentre gli affari riservati, inseriti dal Cantù nell'Archivio riservato, si salvarono dai bombardamenti. C. Cantù costituì l'Archivio riservato, di seguito all'archivio della presidenza, con gli " atti delle varie magistrature e commissioni inquirenti in materia di processi politici dal 1821 al 1848 ". Vi confluirono più tardi altri archivi e fu conservato dal Fumi e dal Vittani; ma fu abolito negli anni 1949-1950 quando le carte in esso conservate furono isolate e riordinate secondo il criterio di provenienza. sono stati aggregati all'archivio della presidenza i documenti superstiti dell'archivio del plenipotenziario imperiale, conte di Bellegarde, presidente della reggenza di governo (maggio 1814-aprile 1815).
L'archivio, suddiviso in ordine cronologico, è lacunoso per gli anni 1841-1842