Era articolata in tre protocolli: generale, segreto e geheim (riservato); quest'ultimo, verso la fine del maggio 1859 fu trasportato a Verona e non se ne ebbe più traccia.
Le carte - ben conservate - degli altri due protocolli sono state mandate al macero nella seconda metà dell'800: rimane soltanto il protocollo segreto del 1859 (1° gennaio-4 giugno), alcuni fascicoli del protocollo generale e alcuni corpi di reato (simboli massonici e carbonari, carte e libri sequestrati)