L'attività di tale organo, che portò tra l'altro alla soppressione di numerosi monasteri a favore dei luoghi pii laicali (vedi opere pie, istituzioni di assistenza e beneficenza, ospedali, Congregazione di carità poi Ente comunale di assistenza di Modena ), ha determinato il formarsi di un archivio tra i più poliedrici e complessi, non articolabile in serie, nel quale, alle relazioni e al carteggio propri dell'ufficio sono frammisti in gran copia documenti e talora interi piccoli fondi di data molto anteriore, richiamati dall'ufficio stesso per l'esercizio delle proprie funzioni o, presumibilmente, aggregativi in seguito dagli archivisti in base al criterio dell'ordinamento per materie. Vi figurano numerose pergamene. I gruppi più omogenei sono quelli relativi alle opere pie, agli ordini regolari e ai benefici; i più antichi quelli relativi ai vescovati di Ferrara, Carpi e Reggio, nonché all'abbazia di Nonantola