La cancelleria nel periodo aragonese, pur continuando a costituire l'ufficio in cui si compilavano e spedivano gli atti di governo, subì ad opera di Alfonso I d'Aragona sostanziali modifiche. Il gran cancelliere, che la presiedeva, fu assistito da un consiglio di reggenti.
La classificazione degli atti e i titoli dei registri mutarono; furono modificate altresì la formulazione e la spedizione degli Atti. Il segretario divenne la figura preminente; egli dettava o stendeva per iscritto l'ordine sovrano, e finì gradualmente col sostituire il cancelliere.