Nel 1198 Innocenzo III incorporò Spoleto nello Stato pontificio, ma solo a partire dal 1247 l'aggregazione divenne definitiva. Nel 1354 l'Albornoz ne fece uno dei punti fortificati più importanti dello Stato.
Dalla seconda metà del sec. XII si ha notizia dell'esistenza in Spoleto della magistratura consolare e dei boni homines, mentre in un documento del 1201 si trova menzionato per la prima volta il podestà  [cfr. A. SANSI, Storia del comune di Spoleto dal secolo XII al XVII..., I, Foligno 1879, p. 132 ]  Qualche studioso afferma che già nel 1263 si sarebbe avuto nella città il capitano del popolo, ma il Sansi  [Ibid., p. 137 ]  trova menzionato per la prima volta tale magistrato - col nome di consul et exgravator comunis et populi Spoleti - un decennio più tardi, e cioè nel 1272 e nel 1273. Un punto fermo nello studio della struttura del comune spoletino è dato dallo statuto del 1296, le cui norme durarono fino all'applicazione della legislazione albornoziana, che peraltro non alterò molto, almeno formalmente, la struttura amministrativa del comune.