Fu istituito a seguito di ordinanza imperiale 15 mag. 1851  [Ibid., 1851, parte II, n. 216]  che stabilì l'organizzazione del servizio dei porti e del servizio sanitario marittimo in tutta la monarchia austriaca. Alle dipendenze di un'autorità centrale marittima - con addetti due ispettori superiori - furono posti quattro uffici centrali dei porti e di sanità marittima, diretti da un capitano, nelle città di Venezia, Trieste, Fiume e Ragusa. In altre sedi furono dislocati altri minori organi: uffici, deputazioni, agenzie, uffici staccati, lazzaretti. Con notificazione del governo centrale marittimo 24 genn. 1852, n. 7654 venne anche attivato dal 1 febbr. un nuovo servizio di porto e sanità marittima