Il consiglio di prefettura, istituito con la l. del 28 piovoso a. VIII / 17 feb. 1800 (  Bulletin des lois  , bull. 17, pp. 3-4), poi con vari decreti estesa ai nuovi dipartimenti annessi all’impero, era composto di un numero di membri variabili da un minimo di tre a un massimo di cinque.
Era presieduto dal prefetto e i membri erano nominati dal primo console (poi dall’imperatore). Si pronunciava sulle domande dei privati volte a ottenere una riduzione della quota di contribuzione diretta; sugli affari insorgenti tra imprenditori e pubblica amministrazione in materia di lavori pubblici; sulle domande d’indennizzo di privati in seguito a esproprio per lavori di pubblica utilità e infine sul contenzioso demaniale.