Istituita a seguito del decreto 6 mag. 1802 con giurisdizione nell'omonimo distretto (dipartimento del Reno) comprendeva i cantoni di Imola, Castel San Pietro, Fontana e Lugo [ In provincia di Ravenna ] ed era posta alle dipendenze della prefettura di Bologna. Soppressa con la legge 27 marzo 1804, fu sostituita con un delegato di prefettura che aveva compiti principalmente di polizia, mentre l'amministrazione ordinaria fu attribuita alla prefettura di Bologna. Con decreto governativo dell'8 ag. 1804 [ Foglio repubblica italiana ] venne creato un delegato di prefettura per il cantone di Lugo, con conseguente sottrazione del relativo territorio alla competenza del delegato di Imola. In applicazione della legge 8 giu. 1805 le due delegazioni furono soppresse e venne ripristinata la viceprefettura di Imola con competenze sul territorio dell'intero distretto. Nel novembre del 1810 vennero attribuite al viceprefetto di Imola anche le funzioni di commissario di guerra. L'occupazione austriaca del gennaio 1814 e quella napoletana del febbraio successivo non provocarono mutamenti nelle funzioni esercitate dalla viceprefettura, che anzi nel maggio 1814, dopo il ritiro in Ancona di Gioacchino Murat ed il ritorno delle truppe imperiali, venne confermata dal governo provvisorio austriaco. Dal gennaio 1815 la viceprefettura fu sostituita da una vicedelegazione di governo. La precedente denominazione ricomparve durante il breve periodo della occupazione del territorio imolese da parte delle truppe napoletane dall'1 al 16 aprile 1815. La conquista austriaca comportò il ripristino della vicedelegazione fino a che, riconsegnati i territori delle legazioni allo Stato pontificio il i9 luglio 1815 e permanendo sempre inalterate le funzioni esercitate, l'ufficio mutò nuovamente la denominazione in quella di vicecommissariato pontificio, con dipendenza dal commissario pontificio in Bologna. Per effetto del motuproprio di Pio VII del 6 lu. 1816 sulla organizzazione dello Stato pontificio, a partire dal 1 settembre 1816, il vicecommissario di Imola venne a cessare ed Imola fu dichiarata sede di governo distrettuale, dipendente dalla legazione di Ravenna